党政办公室
高新园区建设与管理委员会办公室
上海科教基地园区建设与管理委员会办公室
机关综合服务中心
网络安全和信息化办公室
党委组织部（党校）、党委统战部（合署办公）
党委宣传部、新闻中心（合署办公）
校刊编辑部
机关党委
党委教师工作部、人力资源部（合署办公）
党委学生工作部、学生工作处、党委人民武装部（合署办公）
心理教育中心
学生咨询服务中心
党委巡视工作办公室
纪检监察机构
研究生院（校学位委员会办公室）
本科生院
本科生书院
通识教育中心
体育教学中心
艺术教学中心
现代艺术中心
陶瓷艺术中心
外语教学中心
招生就业处
教务处
高等教育研究所
教育与现代化编辑部
现代教育技术中心
教材供应中心
科研部
学报编辑部
学风与科研诚信建设办公室
科技成果转化院
科技成果转化处
大学科技园管理处
资产经营管理处
发展和改革办公室、发展规划处（合署办公）
生命科学与医学建设办公室
文科建设办公室
国际合作与交流部（含港澳台办公室）、国际学院（合署办公）
外事服务中心
国际合作交流推进委员会
对外联络与基金事务处
离退休干部工作处
财务处
审计处
资产与后勤保障处
基本建设处
保卫与校园管理处、实验室安全办公室（合署办公）
居民委员会
团委
工会
保密办公室
少年班学院（少年班、教改试点班）
数学科学学院
数学系
计算与应用数学系
概率统计系
物理学院
物理系
近代物理系
光学与光学工程系
天文学系
工程与应用物理系
物理实验教学中心
化学与材料科学学院
化学物理系
材料科学与工程系
化学实验教学中心
化学系
应用化学系
高分子科学与工程系
工程科学学院
近代力学系
精密机械与精密仪器系
热科学和能源工程系
安全科学与工程系
信息与智能学部
信息科学技术学院
电子工程与信息科学系
自动化系
电子科学与技术系
信息安全专业
信息与计算机实验教学中心
计算机科学与技术学院
计算机科学与技术系
人工智能与数据科学学院
网络空间安全学院
集成电路学院(国家示范性微电子学院)
软件学院
地球和空间科学学院
地球物理与空间科学技术系
地球化学与行星科学系
地球和空间科学探测实验教学中心
生命科学与医学部
生命科学学院
分子生物学与细胞生物学系
神经生物学与生物物理学系
系统生物系
医药生物技术系
基础医学院
临床医学院
附属第一医院
生物医学工程学院（筹）
管理学院
工商管理系
管理科学系
统计与金融系
EMBA中心
MBA中心
MPA中心
MF中心（金融专硕）
项目管理教育中心
公共管理学院
法律硕士教育中心
物流工程硕士中心
人文与社会科学学院
科技史与科技考古系
科技传播系
科技哲学系
心理学系(筹)
语言科学交叉研究中心
艺术与科学研究中心
环境科学与光电技术学院
马克思主义学院
环境学院
核科学技术学院
加速器科学与工程物理系
等离子体物理与聚变工程系
核科学与工程系
未来技术学院
卓越工程师学院
碳中和研究院
科技商学院
深空探测学院（筹建）
深空科学技术研究院
苏州高等研究院
上海研究院
北京研究院
北京教学与管理部
先进技术研究院
创新创业学院
国际金融研究院
国家同步辐射实验室
合肥微尺度物质科学国家研究中心
火灾安全全国重点实验室
精准智能化学全国重点实验室
免疫应答与免疫治疗全国重点实验室
岩石圈演化与环境演变全国重点实验室
精密大地测量与定位全国重点实验室
空天飞行高温气动全国重点实验室
先进环境装备与污染防治技术全国重点实验室
量子信息与量子科技创新研究院
核探测与核电子学国家重点实验室
语音及语言信息处理国家工程实验室
类脑智能技术及应用国家工程实验室
国家高性能计算中心（合肥）
大尺度火灾国际联合研究中心
中国科学院合肥大科学中心
中国科学院比较行星学卓越创新中心
合肥物质科学技术中心
公共实验中心
理化科学实验中心
生命科学实验中心
工程与材料科学实验中心
信息科学实验中心
超级计算中心
微纳研究与制造中心
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信息管理办公室
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附属中学
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修缮服务中心
环卫绿化中心
学生社区服务中心
基础教育集团
幼儿园
中科大附中实验学校
中科大高新实验幼儿园
合肥智能机械研究所
中国科学院合肥物质科学研究院
中国科学院金属研究所
长春应用化学研究所
南京分院
紫金山天文台
南京地质古生物研究所
南京天文仪器研制中心
苏州纳米技术与纳米生物仿生研究所
苏州生物医学工程技术研究所
中国工程物理研究院
广州能源研究所
赣江创新研究院
安徽蒙城地球物理国家野外科学观测站
管理学院（北京）
高等研究院
联想计算机学院
中国科学院热安全工程技术研究中心
中国科学院核能安全技术研究所
理化科学中心
天体物理中心
非线性中心
烟草与健康研究中心
华为信息技术研究所
安徽省高性能计算与应用重点实验室
安徽省分子医学重点实验室
安徽省光电子科学与技术重点实验室
安徽大数据应用协同创新中心
先进核聚变能和等离子体科学协同创新中心
能源材料化学协同创新中心
宇航科学与技术协同创新中心
基本粒子和相互作用协同创新中心
城市公共安全协同创新中心
先进技术与产业协同创新中心
苏州纳米科技协同创新中心
物资供应中心
